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正常新鲜的粪便多呈棕黄色，是由于含有粪胆素的缘故。如粪中含有未消化的蔬菜时，可带绿色或菜绿色。新生儿胎粪呈墨绿色，性状多呈软泥样，吃奶婴儿大便多溏。粪便不混有粘液、脓血、寄生虫体等。显微镜检查可见少量植物细胞、肌肉纤维等，而无红细胞、白细胞、寄生虫卵。隐血试验为阴性。
大便颜色的改变。红色，可见于肠道出血，如肛裂、肠息肉或吃大量的蕃茄、西瓜等。果酱色，见于肠套叠或阿米巴痢疾。陶土（灰白）色，见于新生儿胆道畸形，如胆道闭锁；较大儿童可见于胆道梗阻等。黑色或柏油状，见于小肠以上部位出血、溃疡等。
大便性状的改变。水样便，见于急性肠炎、食物中毒等。带有少量粘液或如蛋花汤样，多见于“秋季腹泻”。如米泔水样，可见于霍乱。赤豆汤样大便，见于出血性坏死性小肠炎。如大便色绿如海水样，多见于金黄色葡萄球菌性肠炎。粘液，见于各种肠道感染、炎症。脓血便，主要见于细菌性痢疾和阿米巴痢疾以及某些肠炎。此外，大便中有泡沫，表示进食糖类过多；如奶片较多，表示进乳多，脂肪或蛋白质消化不全；如粪便中浮有“油花”，多系脂肪类进食过多、不消化所致。
粪便涂片显微镜检查。红细胞见于细菌性痢疾、阿米巴痢疾、出血性肠炎，以及肠道出血、肠结核、过敏性紫癜等。白细胞（脓细胞）表示肠道炎症、细菌性痢疾、阿米巴痢疾等，其量的多少与炎症程度有关。吞噬细胞主要见于急性菌痢。寄生虫卵，如蛔虫、蛲虫、钩虫、鞭虫卵等，以及原虫如阿米巴、滴虫等，表示该种寄生虫感染。食物残渣、淀粉颗粒、肌纤维、脂肪滴等，表示消化功能减退。大便中查到夏科―雷登氏结晶，多见于阿米巴痢疾、肠道寄生虫病、肠道溃疡或其它过敏性疾病。
大便化学检查。隐血试验：粪便中有少量血液，用肉眼看不出时称为隐血。如上消化道出血量少于１００毫升，用肉眼及镜检常不能发现，但隐血试验却可以查出。隐血试验阳性提示消化道有出血。如结果时阴时阳则溃疡可能性大。粪胆素定性试验，健康人呈阳性。如果胆总管阻塞，粪胆素试验则为阴性，所以，本试验可用来诊断阻塞性黄疸。由于本试验没有尿三胆试验简单方便、迅速，所以临床很少使用。
一般而言，大便的颜色、性状对疾病的诊断很有帮助，而显微镜检查则对确定疾病的性质较为重要。如同样是稀水便，镜检主要是脂肪球，而无红、白细胞等，在婴儿则消化不良可能性大。如果是大量的白细胞，则可能是急性肠炎。如果以红细胞为主，则可能是肠道出血或坏死性肠炎等。对于肠道寄生虫、阿米巴等，镜检则有诊断意义，只要发现就可以确定诊断。
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