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(二)抗组蛋白抗体
组蛋白是染色质的基本结构核小体的重要组成部分。H1在DNA双螺旋之外，DNA双螺旋包绕于由H3、H2A、H2B、H4组成的核心。抗组蛋白抗体采用ELISA检测，可以在多种自身免疫性结缔组织病中出现。药物引起的狼疮其抗组蛋白抗体达95%。我们用ELISA对109例SLE、117例类风湿关节炎(RA)、46例干燥综合征(SS)、22例硬皮病(SD)、25例其他结缔组织病、29例非结缔组织病及长期服用他巴唑22例、苯妥英钠55例和异烟肼198例病人，进行了血清抗组蛋白抗体测定，其阳性率分别为50%、23%、33%、27%、36%、10%、0%、18%和53%。抗组蛋白抗体的滴度在SLE病人和服用异烟肼的病人中最高。进一步分析后发现，在SLE病人中主要以抗H2B、抗H2A-2B和抗H1为主且主要是IgG型抗体。而在服用异烟肼的病人中，抗组蛋白H1、H2A、H2B、H3和H4的滴度基本一致，且不以IgG型抗体为主。在服用异烟肼具有抗组蛋白阳性的病人，临床上并没有出现狼疮的临床症状。不同药物所致的抗组蛋白的亚单位抗体不同，如服用肼苯哒嗪的抗组蛋白抗体主要是抗H3和抗H4抗体，而由普鲁卡因酰胺所致的抗组蛋白抗体主要为抗H2A-2B复合物抗体。
(三)抗非组蛋白抗体
1.抗ENA(Extractable Nuclear Antigen)抗体：
此组抗原不含组蛋白，可以溶于盐水而被提取。此类抗体与疾病的严重程度或其活动性无明显相关。
(1) 抗nRNP(nuclear RNP)：以抗核内的核糖核蛋白而得名。临床上应用较多的是u1RNP抗体。通常又把nRNP称之为u1RNP。u1RNP由u1RNA和9种不同的蛋白质组成。具有抗原性蛋白的分子量有70KD、30KD(A)和22KD(C)。60%抗u1RNP可与B、B，多肽出现微弱的反应。抗u1RNP抗体在混合性结缔组织病(Mixed connective tissue diseases，MCTD)中几乎均为阳性，且其滴度很高；在其他结缔组织病中阳性率低且滴度低；它是区分结缔组织病和非结缔组织病的有力指标。抗u1RNP抗体阳性的病人，常有双手肿胀、雷诺现象、肌炎和指(趾)端硬化。有人认为抗u1RNP抗体阳性的SLE病人，如抗dsDNA抗体阴性，则肾病发生率较低；如若与抗dsDNA、抗Sm抗体同时存在，则发生狼疮性肾炎的可能性较大。
(2) 抗Sm抗体：以病人名字(Smith)命名。已知Sm是核内小核糖体蛋白(SuRNP)，含有除u3RNA外的所有u族RNA。其抗原决定簇主要在与u1、u2、u4-u6RNA连接的B和D蛋白多肽上，已知蛋白多肽的分子量B(29KD)、B，(28KD)、D(16KD)。抗Sm抗体的蛋白多肽较高特异性的为B和D带。国际上通常用对流电泳和免疫双扩散法检测抗Sm抗体，其阳性率在SLE中为30%左右，抗Sm抗体对早期、不典型的SLE或经治疗缓解后SLE回顾性诊断有很大帮助。
必须强调指出，Sm和nRNP是同一分子复合物(RNA-蛋白颗粒)中的不同抗原位点，其中的RNA富含尿嘧啶核苷(u1、u2、u4-u6)，如前述，Sm含有u1、u2和u4-u6，而nRNP(u1RNP)仅含u1RNA。从理论上讲，测得抗Sm抗体的同时，也应测得抗u1RNP；而测得抗u1RNP则抗Sm抗体亦可为阴性。我院开展临床检测20余年来，用电泳和双扩散法，尚未有抗Sm抗体阳性而抗u1RNP抗体阴性，也即抗Sm抗体阳性均伴有抗u1RNP抗体，但抗u1RNP抗体可以单独存在。
抗u2RNP抗体在系统性硬化症伴多发性肌炎的重叠综合征中阳性频率较高。银屑病及雷诺现象的病人也可呈阳性。
抗u3RNP抗体常与系统性硬化相关，且常伴有原发性肺动脉高压、骨骼肌和小肠受累。
(3) 抗SSA/RO抗体：由于该抗体与干燥综合征(Sjogren syndrome，SS)相关，故取名为SSA，也有人取名于最早检测到的病人名字Ro。SSA与Ro的抗原性、生化特点一致。SSA/Ro是含有Y-YRNA的蛋白质，更多存在于胞浆内。在以鼠肝为底物的ANA检测中，抗SSA抗体常呈阴性反应，而以Hep-2细胞为底物，则ANA为阳性。
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