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来自第五届地坛国际感染病会议（7.14～17日报道 北京大学医学部蒋素贞（S.Z. Yang）等对合并HBV感染肝细胞癌（HCC）患者肿瘤组织和相应配对非肿瘤组织中的病毒宿主基因组接头序列（junction sequences）进行了分析。他们发现，HBV DNA整合可见于肿瘤和非肿瘤组织，HBV C或X区域的整合率相似。在肿瘤组织和相应的非肿瘤组织中，整合的X基因3’截断缺失发生频率相似，不支持其参与了肝癌形成。染色体不稳定（CIN）与HBV整合之间无明显关联。对于肿瘤组织中的周围基因或经HBV整合破坏的基因，按功能分类其与转录、细胞核等更相关，提示影响周围基因表达的HBV整合是以前未被发现的一种导致细胞恶性转变的分子机制。 研究者使用盒式接头介导的聚合酶链式反应（LM-PCR）、Alu-PCR和直接测序法，分析来自合并HBV感染肝细胞癌（HCC）患者肿瘤组织和相应配对非肿瘤组织中的病毒宿主基因组接头序列（junction sequences）。根据获得的人类基因组的侧翼序列绘制整合位点图。对潜在的影响基因（经整合直接中断或在病毒－宿主接头上下游100kb内出现的基因）根据其功能进行分类，通过基因本体论（gene ontology，GO）进行聚类分析。通过直接测序筛选出TP53体细胞突变和杂合性缺失（LOH）。通过基于阵列比较基因组杂交（aCGH）检出肿瘤组织中的染色体畸变。
在68%（34/50）的肿瘤组织和70%（35/50）的非肿瘤组织中，研究者共识别出232个不同的病毒宿主序列。其中，在87.52%（71/84）的肿瘤组织中的整合和82.43%（122/148）的非肿瘤组织中的整合中确认了染色体位点。在包括X和Y染色体的所有染色体中，病毒插入位置分布均匀。但是，35.71%（30/84）的整合见于肿瘤组织中宿主基因的外显子或内含子序列，在非肿瘤组织中为35.13%（52/148）。进一步GO分析显示，影响基因富集于转录调节区（9/31）和细胞核中（12/31），有显著统计学意义。这种富集在非肿瘤组织中并未观察到。肿瘤组织中的179个基因和非肿瘤组织中的313个基因，处于病毒宿主接界上下游100 kb内或已被HBV整合破坏。GO分析证实，与代谢、转录和NDA结合相关的基因更常见于肿瘤组织（而非非肿瘤组织）。尤其是，在肿瘤组织中，23.46%（42/179）的基因与转录相关，在非肿瘤组织中则只发现了很少量的与转录相关基因。对于HBV基因组，59.48%（138/232）整合子含有X区序列，40.52%（94/232）的整合子含有前C/C区序列。整合子的断点主要分布在HBV的DR1和DR2间。由整合引起的3’X基因缺失百分比在肿瘤组织中为97.96%（48/49），在非肿瘤组织中为95.51%（85/89）（P>0.05）。通过免疫组织化学法对这些整合的3’截断X基因（3’truncated X gene ）进一步分析，检出了肿瘤组织中只有很少HBx表达。此外，aCGH研究数据提示，染色体不稳定和HBV整合之间没有直接关联，而TP53突变或LOH可见于大多数染色体较不稳定的肿瘤组织。
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