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因此，糖肽肿瘤疫苗研究的第一个问题就是如何筛选出既能够产生很强的免疫反应，又能杀死肿瘤细胞的糖肽。李艳梅和该项目团队首先采用了最经典、最传统的疫苗设计思路，顺利筛选出了含有上述糖肽的载体蛋白。
在此基础之上，通过反复实验，李艳梅及其团队最终将糖肽链与脂肽链连在了一起，合成了糖肽、多肽加脂肽的三组式疫苗。李艳梅表示，此前曾尝试过将这个较大的载体蛋白简化成比较小的多肽，这样虽也能起到免疫作用，但效果并不是很好。而MUC1型糖肽疫苗抗原具有很好的免疫原性，一些位点的糖基化具有很好的免疫特性，效果是最好的。
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